Mathilde Bouvel ; Marni Mishna ; Cyril Nicaud - Some simple varieties of trees arising in permutation analysis

dmtcs:2346 - Discrete Mathematics & Theoretical Computer Science, January 1, 2013, DMTCS Proceedings vol. AS, 25th International Conference on Formal Power Series and Algebraic Combinatorics (FPSAC 2013) - https://doi.org/10.46298/dmtcs.2346
Some simple varieties of trees arising in permutation analysisConference paper

Authors: Mathilde Bouvel 1; Marni Mishna 2; Cyril Nicaud ORCID3

[en]
After extending classical results on simple varieties of trees to trees counted by their number of leaves, we describe a filtration of the set of permutations based on their strong interval trees. For each subclass we provide asymptotic formulas for number of trees (by leaves), average number of nodes of fixed arity, average subtree size sum, and average number of internal nodes. The filtration is motivated by genome comparison of related species.

[fr]
Nous commençons par étendre les résultats classiques sur les variétés simples d'arbres aux arbres comptés selon leur nombre de feuilles, puis nous décrivons une filtration de l'ensemble des permutations qui repose sur leurs arbres des intervalles communs. Pour toute sous-classe, nous donnons des formules asymptotiques pour le nombre d'arbres (comptés selon les feuilles), le nombre moyen de nœuds d'arité fixée, la moyenne de la somme des tailles des sous-arbres, et le nombre moyen de nœuds internes. Cette filtration est motivée par des problématiques de comparaison de génomes.


Volume: DMTCS Proceedings vol. AS, 25th International Conference on Formal Power Series and Algebraic Combinatorics (FPSAC 2013)
Section: Proceedings
Published on: January 1, 2013
Imported on: November 21, 2016
Keywords: [INFO.INFO-DM]Computer Science [cs]/Discrete Mathematics [cs.DM], [en] permutations, simple varieties of trees, random generation, tree parameters, asymptotic formulas
Funding:
    Source : OpenAIRE Graph
  • Funder: Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada

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